A Kémia Diákolimpia szervezésének ötlete 1968-ban egy csehszlovák nemzeti verseny során merült fel, ahová lengyel és magyar megfigyelőket is meghívtak. Ez a három nemzet vett részt az első olimpián, amelyet még abban az évben rendeztek Prágában. Azóta folyamatosan bővül a résztvevők köre.